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Enregistrement W1983624151 · doi:10.1039/c4mt00315b

Iron-dependent turnover of IRP-1/c-aconitase in kidney cells

2015· article· en· W1983624151 sur OpenAlexafffund
Ying Liu, Douglas M. Templeton

Notice bibliographique

RevueMetallomics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAconitaseChemistryKidneyCell biologyProtein turnoverGlutamate receptorBiochemistryBiologyProtein biosynthesisMitochondrionEndocrinologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The kidney plays an important role in iron homeostasis and actively reabsorbs citrate. The bifunctional iron-regulatory protein IRP-1 potentially regulates iron trafficking and participates in citrate metabolism as a cytosolic (c-) aconitase. We investigated the role of cellular iron status in determining the expression and dynamics of IRP-1 in two renal cell types, with the aim of identifying a role of the protein in cellular ROS levels, citrate metabolism and glutamate production. The effects of iron supplementation and chelation on IRP-1 protein and mRNA levels and protein turnover were compared in cultured primary rat mesangial cells and a porcine renal tubule cell line (LLC-PK1). Levels of ROS were measured in both cell types, and c-aconitase activity, glutamate, and glutathione were measured in LLC-PK1 cells, with and without IRP-1 silencing and in glutamine-supplemented or nominally glutamine-free medium. Iron supplementation decreased IRP-1 levels (e.g., approx. 40% in mesangial cells treated with 10 μg ml(-1) iron for 16 h) and increased ubiquitinated IRP-1 levels in both cells types, with iron chelation having the opposite effect. Although iron increased ROS levels (three-fold with 20 μg ml(-1) iron in mesangial cells and more modestly by about 30% with 50 μg ml(-1) in LLC-PK1 cells, both after 24 h), protein degradation was not ROS-dependent. In LLC-PK1 cells, 10 μg ml(-1) iron (24 h) increased both aconitase activity (30%) and secreted glutamate levels (65%). Silencing did not remove the glutamate response to iron but decreased the c-aconitase activity of the residual protein independent of iron loading (37% and 46% of control levels, without and with iron treatment, respectively). However, in glutamine-free medium, glutamate was still increased by iron, even in IRP-1-silenced cells, and did not correspond to c-aconitase. Silencing decreased the amount of ferritin measured in response to iron loading, decreased the affect of iron on total glutathione by 48%, and increased the response of ROS to iron loading by 38%. We conclude that iron increases turnover of IRP-1 in kidney cells, while increasing aconitase activity, suggesting that the apoprotein (aconitase-inactive) form is not exclusively responsible for turnover. Iron increases glutamate levels in tubule epithelial cells, but this appears to be independent of c-aconitase activity or the availability of extracellular glutamine. IRP-1 protein levels are not regulated by ROS, but IRP-1-dependent ferritin expression may decrease ROS and increase total glutathione levels, suggesting that ferritin levels are more important than citrate metabolism in protecting renal cells against iron.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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