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Enregistrement W1983996961 · doi:10.1111/j.1365-3059.2009.02052.x

Phytoplasma associated with a witches’ broom disease of <i>Gleditsia sinensis</i> (Fabaceae) newly reported in China

2009· article· en· W1983996961 sur OpenAlexaff
H. Min, Z. N. Li, Yu-Da Wu, Shiu-Ying Hu, C. P. Zhang, Kuan Wu

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytoplasmas and Hemiptera pathogens
Établissements canadiensScience North
Organismes subventionnairesHigher Education Discipline Innovation ProjectNational Science Foundation
Mots-clésPhytoplasmaBiologyHaeIIIRestriction fragment length polymorphismBroom16S ribosomal RNABotanyPolymerase chain reactionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gleditsia sinensis (Chinese honeylocust) is widely distributed in China due to its important use in traditional Chinese medicine. In August of 2008, G. sinensis trees in Shanxi Province, exhibited symptoms of witches’ broom, stunting, smaller leaves, and yellowing gradually becoming browning: a phytoplasma infection was suspected. Total DNA was extracted from 0·5 g of phloem tissue from leaf midribs and stems of eight plants with, and eight plants without symptoms (Angelini et al., 2001). DNA was analyzed for phytoplasma by a nested PCR assay using phytoplasma universal 16S rDNA primers R16mF1/R16mR1 and R16F2n/R16R2 (Gundersen & Lee, 1996). PCR products of 1·4 and 1·2 kb, respectively, were produced from all plants with symptoms, but not from symptomless plants. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analyses of R16F2n/R16R2 amplicons with AluI, HhaI, TaqI, EcoRI, HaeIII, RsaI and HpaII endonucleases, indicated that all plants with symptoms contained a phytoplasma strain of group 16SrV (‘Candidatus Phytoplasma ulmi’), subgroup B (16SrV-B). The G. sinensis phytoplasma 16S rDNA sequence (GenBank Accession No. FJ457095) scored the highest identity (99%) with those of group 16SrV, thereby confirming strain identity based on RFLP. Phytoplasmas of 16SrV have previously reported on jujube (Zhu et al., 1997) and paper mulberry (Liu et al., 2004) causing witches’ broom in China. This is the first report of a ‘Candidatus Phytoplasma ulmi’-related strain affecting G. sinensis in China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,267
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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