Structural Insight into G-Protein Coupled Receptor Binding by Apelin
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Apelin peptides are the cognate ligands for the G-protein coupled receptor APJ, with functions in the cardiovascular and central nervous systems, in glucose metabolism and as a human immunodeficiency virus (HIV-1) coreceptor. Apelin is found in 13-36 residue forms in vivo. The structures of five isoforms of apelin at physiological versus low (5-6 degrees C) temperature are compared here using circular dichroism (CD) and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, demonstrating increased structure at low temperature. Far-ultraviolet (UV) CD spectra are predominantly random coil for apelin isoforms, but are convoluted by unusual bands from the C-terminal phenylalanine side chain. These bands, assigned using F13A-apelin-13, are accentuated at 5 degrees C and imply conformational restriction. At 35 degrees C, the R6-L9 region of apelin-17 is well structured, consistent with previous mutagenesis results showing necessity of this segment for apelin-APJ binding and activation. At 5 degrees C, R6-L9 retains its structuring while the functionally critical C-terminal G13-F17 region also becomes highly structured. Type IV beta-turns and some polyproline-II structure alongside F17 side chain motional reduction correlate well with CD spectral properties. Cis-trans peptide bond isomerization at P14 and P16 produces two sequentially assignable conformers (both trans:both cis approximately 4:1) alongside less populated conformers. Chemical shift assignment of apelin-12, -13 and pyroglutamate-apelin-13 implies highly similar structuring and the same isomerization at the C-terminus. Based on the apelin-17 structure, a two-step binding and activation mechanism is hypothesized.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle