Structural Insight into G-Protein Coupled Receptor Binding by Apelin
Notice bibliographique
Résumé
Apelin peptides are the cognate ligands for the G-protein coupled receptor APJ, with functions in the cardiovascular and central nervous systems, in glucose metabolism and as a human immunodeficiency virus (HIV-1) coreceptor. Apelin is found in 13-36 residue forms in vivo. The structures of five isoforms of apelin at physiological versus low (5-6 degrees C) temperature are compared here using circular dichroism (CD) and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, demonstrating increased structure at low temperature. Far-ultraviolet (UV) CD spectra are predominantly random coil for apelin isoforms, but are convoluted by unusual bands from the C-terminal phenylalanine side chain. These bands, assigned using F13A-apelin-13, are accentuated at 5 degrees C and imply conformational restriction. At 35 degrees C, the R6-L9 region of apelin-17 is well structured, consistent with previous mutagenesis results showing necessity of this segment for apelin-APJ binding and activation. At 5 degrees C, R6-L9 retains its structuring while the functionally critical C-terminal G13-F17 region also becomes highly structured. Type IV beta-turns and some polyproline-II structure alongside F17 side chain motional reduction correlate well with CD spectral properties. Cis-trans peptide bond isomerization at P14 and P16 produces two sequentially assignable conformers (both trans:both cis approximately 4:1) alongside less populated conformers. Chemical shift assignment of apelin-12, -13 and pyroglutamate-apelin-13 implies highly similar structuring and the same isomerization at the C-terminus. Based on the apelin-17 structure, a two-step binding and activation mechanism is hypothesized.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».