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Enregistrement W1985168670 · doi:10.1021/jp002761u

A Single-Crystal Electron Paramagnetic Resonance Study at 95 GHz of the Type 1 Copper Site of the Green Nitrite Reductase of <i>Alcaligenes f</i><i>aecalis</i>

2001· article· en· W1985168670 sur OpenAlexafffund
Maurice van Gastel, Martin J. Boulanger, Gerard W. Canters, Martina Huber, M.E.P. Murphy, Martin Ph. Verbeet, E. J. J. Groenen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2001
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueChemical Reactions and Isotopes
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMedical Research Council CanadaNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésNitrite reductaseElectron paramagnetic resonanceCopperNitriteChemistrySingle crystalNuclear magnetic resonanceCrystallographyPhysicsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An electron-spin-echo−detected electron paramagnetic resonance (EPR) study has been performed for the type 1 copper site of the green nitrite reductase of Alcaligenes faecalis . Accurate g values and principal directions of the g tensor have been obtained. The z principal axis of the g tensor makes an angle of 60° with the direction from copper to the Sδ of the axial methionine. The direction of this axis is compared with that of the blue type 1 proteins azurin and M121Q azurin and of the green type 1 protein M121H azurin, and interpreted in terms of the d orbital at copper in the wave function of the unpaired electron. This d orbital is oriented such that the overlap with the lone-pair orbitals of the ligands is maximum. The relation between the absorption spectrum in the visible, the copper−thiolate interaction, and the rhombicity of the EPR spectrum of type 1 proteins is discussed in terms of the trigonal and tetragonal character of the copper sites and the position and strength of the axial ligand.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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