The proximal cis‐regulatory region of the <i>RHD</i>/<i>RHCE</i> promoter is 105 bp and contains a 55‐bp core devoid of known binding motifs but necessary for transcription
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The RhD and RhCE polypeptides are erythroid-specific members of the RH gene family. Little is known about the promoter cis-regulatory proximal region responsible for transcription. STUDY DESIGN AND METHODS: The 1246-bp 5'-flanking regions of the RHD and RHCE promoter were amplified and ligated to a luciferase reporter vector and erythroid-specific transcription was evaluated in K562, HEL, U937, and HeLa cell lines. Deletion and substitution promoter-reporter constructs were generated to define the minimal cis-regulatory region. RESULTS: Deletion analysis in K562 cells revealed that the cis-regulatory region extended to a position between -78 and -120 relative to the site of initiation of transcription. Electrophoretic mobility shift assays confirmed binding motifs for Sp1, GATA-1, and E2F transcription factors. The use of 15-bp substitution mutagenesis showed that the minimal region required for transcription extended to -105 bp, and 6-bp substitution mutants from -35 to -90 identified a region necessary for transcription yet devoid of known cis-regulatory binding motifs. CONCLUSION: The proximal RHD/RHCE promoter regions contain cis-regulatory binding motifs and an internal sequence-dependent region that together regulate transcription. The results suggest that this region may be relevant in the weak expression of RhD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».