The complete N-terminal extension of heparin cofactor II is required for maximal effectiveness as a thrombin exosite 1 ligand
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Heparin cofactor II (HCII) is a circulating protease inhibitor, one which contains an N-terminal acidic extension (HCII 1-75) unique within the serpin superfamily. Deletion of HCII 1-75 greatly reduces the ability of glycosaminoglycans (GAGs) to accelerate the inhibition of thrombin, and abrogates HCII binding to thrombin exosite 1. While a minor portion of HCII 1-75 can be visualized in a crystallized HCII-thrombin S195A complex, the role of the rest of the extension is not well understood and the affinity of the HCII 1-75 interaction has not been quantitatively characterized. To address these issues, we expressed HCII 1-75 as a small, N-terminally hexahistidine-tagged polypeptide in E. coli. RESULTS: Immobilized purified HCII 1-75 bound active α-thrombin and active-site inhibited FPR-ck- or S195A-thrombin, but not exosite-1-disrupted γT-thrombin, in microtiter plate assays. Biotinylated HCII 1-75 immobilized on streptavidin chips bound α-thrombin and FPR-ck-thrombin with similar KD values of 330-340 nM. HCII 1-75 competed thrombin binding to chip-immobilized HCII 1-75 more effectively than HCII 54-75 but less effectively than the C-terminal dodecapeptide of hirudin (mean Ki values of 2.6, 8.5, and 0.29 μM, respectively). This superiority over HCII 54-75 was also demonstrated in plasma clotting assays and in competing the heparin-catalysed inhibition of thrombin by plasma-derived HCII; HCII 1-53 had no effect in either assay. Molecular modelling of HCII 1-75 correctly predicted those portions of the acidic extension that had been previously visualized in crystal structures, and suggested that an α-helix found between residues 26 and 36 stabilizes one found between residues 61-67. The latter region has been previously shown by deletion mutagenesis and crystallography to play a crucial role in the binding of HCII to thrombin exosite 1. CONCLUSIONS: Assuming that the KD value for HCII 1-75 of 330-340 nM faithfully predicts that of this region in intact HCII, and that 1-75 binding to exosite 1 is GAG-dependent, our results support a model in which thrombin first binds to GAGs, followed by HCII addition to the ternary complex and release of HCII 1-75 for exosite 1 binding and serpin mechanism inhibition. They further suggest that, in isolated or transferred form, the entire HCII 1-75 region is required to ensure maximal binding of thrombin exosite 1.
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
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