Electron Capture Dissociation of Electrosprayed Protein Ions for Spatially Resolved Hydrogen Exchange Measurements
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Mass spectrometry (MS) methods involving gas-phase fragmentation hold considerable promise for analyzing regioselective deuteration patterns of proteins following solution-phase amide hydrogen exchange (HX). However, the general viability of such an approach is questionable due to the possible occurrence of intramolecular hydrogen migration ("scrambling"), which tends to randomize or distort the spatial isotope distribution. Rand et al. (J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 1341-1349) have recently reported the application of electron capture dissociation (ECD) for measuring deuteration patterns of short peptides with very little scrambling by FT-MS. The current work shows that even much larger systems such as the 76-residue protein ubiquitin can be successfully analyzed by ECD following solution-phase HX. The resulting c and z. ion deuteration levels are in remarkable agreement with previous NMR data, demonstrating that the extent of scrambling and/or other gas-phase artifacts is negligible. These results open the door to future experiments on the folding, structure, and dynamics of proteins by HX/ECD-FT-MS.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle