MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1986314791 · doi:10.1142/s0218339013500083

ON MODELING OF LIVING ORGANISMS USING HIERARCHICAL COARSE-GRAINING ABSTRACTIONS OF KNOWLEDGE

2012· article· en· W1986314791 sur OpenAlex
Youcef Derbal

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Systems · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene Regulatory Network Analysis
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceOrganismAbstractionTheoretical computer scienceLiving systemsGranularityRepresentation (politics)Living cellFunction (biology)Data scienceLiving matterBiochemical engineeringArtificial intelligenceBiological systemBiologyProgramming languageEngineeringEpistemology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High throughput technologies such as gene expression microarray, ChIP-chips, siRNA and protein arrays and high throughput mass spectrometry are enabling an ever increasing amount of data becoming available about DNA, RNA, proteins, metabolites as well as biological pathways and networks. The knowledge embedded in this data deluge needs to be recast in forms that lend themselves to analysis with the expectation of developing analytical instruments to gain insight and answer questions about life and living organisms. The powers of abstraction and model building are fundamental to the quest of making sense of the biological complexity embedded in these biological and clinical datasets. The modeling of living organisms is explored with a proposed framework for model representation of biological complexity. The principal foundational assumption of the proposed modeling philosophy recognizes the symbiotic relationship between information and energy flows, required for the transformation of matter, as a fundamental organizing force underlying the observable nature of living organisms. The use of the concept of regularities to refer to complexity of structure, function and dynamics alike provides a unified approach to the reasoning about the integration of knowledge representations of varying natures and scales of granularities. The application of the proposed modeling approach is illustrated in broad qualitative terms for the human organism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,591
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle