Taxonomic identification of rhizospheric actinobacteria isolated from Algerian semi-arid soil exhibiting antagonistic activities against plant fungal pathogens
Notice bibliographique
Résumé
The rhizosphere is a rich source of actinobacteria and some members of this bacterial group present strong abilities in the biocontrol of plant diseases. In the present study, 72 strains of actinobacteria were isolated from different rhizospheric semi-arid soils collected in Algeria. Their in vitro antagonistic activity was assayed toward the following plant pathogenic fungi: Verticillium dahliae, Fusarium culmorum, Drechslera teres, Microdochium nivale, Bipolaris sorokiniana, Botrytis fabae and Fusarium oxysporum. All isolates showed chitinolytic activity and six isolates (Lac1, Lac3, Vic8, Pin10, Pru14 and Pru16), which inhibited the growth of five or more of the fungi tested, were selected for further study. According to morphological and physiological characteristics, as well as phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequences, isolates Lac1, Lac3, Pru14 and Pru16 were identified as members of the genus Streptomyces, namely S. griseus, S. rochei, S. anulatus and S. champavatii, respectively. Two isolates, Vic8 and Pin10, were associated with the Nocardiopsis genus and identified as N. dassonvillei subsp. dassonvillei and N. alba, respectively. While antagonism of Streptomyces has been demonstrated against a wide variety of plant pathogens, only a few studies have reported production of antifungal products by the genus Nocardiopsis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».