Assigning morphological variants of <i>Fucus</i> (Fucales, Phaeophyceae) in Canadian waters to recognized species using DNA barcoding
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Notice bibliographique
Résumé
The intertidal brown algal genus Fucus (Phaeophyceae) consists of individuals with a generally dichotomously branched habit. Morphological variability within species, combined with morphological similarity between species, renders field identification difficult. In light of recent taxonomic revisions, which reduced 10 taxa traditionally recognized in Canada to four species, we tested the utility of the DNA barcode (mitochondrial cytochrome oxidase 1, 5′) for assigning individuals to these species. We sequenced the DNA barcode for 125 specimens representing all morphologies recognized. We confirmed our results by sequencing the internal transcribed spacer region for 66 specimens. This is the first study to establish that the DNA barcode successfully assigns different morphologies of brown algae to known species as well as other single-gene molecular markers currently used. Furthermore, the results uncovered substantial phenotypic plasticity in Pacific Fucus distichus , from moss-like fragments embedded in estuarine mud, strap-like morphs on exposed rocky coasts, to “spiralis”-like morphs in the upper intertidal whereas phenotypic expression for this species was more restricted in the Atlantic.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle