Influence of DNA conformation and role of<i>comA</i>and<i>recA</i>on natural transformation in<i>Ralstonia solanacearum</i>
Notice bibliographique
Résumé
Naturally competent bacteria such as the plant pathogen Ralstonia solanacearum are characterized by their ability to take up free DNA from their surroundings. In this study, we investigated the efficiency of various DNA types including chromosomal linear DNA and circular or linearized integrative and (or) replicative plasmids to naturally transform R. solanacearum. To study the respective regulatory role of DNA transport and maintenance in the definite acquisition of new DNA by bacteria, the natural transformation frequencies were compared with those obtained when the bacterial strain was transformed by electroporation. An additional round of electrotransformation and natural transformation was carried out with the same set of donor DNAs and with R. solanacearum disrupted mutants that were potentially affected in competence (comA gene) and recombination (recA gene) functions. Our results confirmed the critical role of the comA gene for natural transformation and that of recA for recombination and, more surprisingly, for the maintenance of an autonomous plasmid in the host cell. Finally, our results showed that homologous recombination of chromosomal linear DNA fragments taken up by natural transformation was the most efficient way for R. solanacearum to acquire new DNA, in agreement with previous data showing competence development and natural transformation between R. solanacearum cells in plant tissues.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».