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Enregistrement W1987175610 · doi:10.1074/jbc.m109.018838

Kaposi Sarcoma-associated Herpesvirus Latency-associated Nuclear Antigen Inhibits Interferon (IFN) β Expression by Competing with IFN Regulatory Factor-3 for Binding to IFNB Promoter

2010· article· en· W1987175610 sur OpenAlexafffund
Nathalie Cloutier, Louis Flamand

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPrimary effusion lymphomaBiologyKaposi's sarcoma-associated herpesvirusInterferon regulatory factorsIRF4VirologyTranscription factorLytic cycleIRF3InterferonNuclear proteinVirus latencyPromoterMolecular biologyGene expressionViral replicationGeneVirusGeneticsHerpesviridae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Host cells respond to viral infections by synthesizing and producing antiviral molecules such as type I interferons (IFN). The Kaposi sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) encodes multiple proteins expressed during the lytic replication cycle that alter the antiviral response of the host. Considering that in Kaposi sarcoma lesions and primary effusion lymphoma cells KSHV is latent in the vast majority of cells, we were interested in determining whether latently expressed viral proteins have the ability to modulate IFN synthesis. The latency-associated nuclear antigen (LANA-1) is a large nuclear protein that plays a role in the establishment and maintenance of latent KSHV episome in the nucleus of infected cells. LANA-1 is also described to modulate the cellular transcription. Here, we report that LANA-1 inhibits IFN-beta transcription and synthesis by competing with the binding of interferon regulatory factor-3 (IRF3) to the IFNB promoter. Using mutants of LANA-1, we have identified the central acidic repeated region as the domain essential for interfering with the binding of IRF3 to the positive regulatory domains I-III of the IFNB promoter. In addition, the nuclear localization of LANA-1 proved essential for IFN-beta inhibition. Thus, LANA-1 interferes with the formation of IFN-beta enhanceosome by competing with the fixation of IRF3 and by inhibiting the expression of the CREB-binding protein. The ability of LANA-1 to inhibit IFNB gene expression highlights a new role for this protein in cellular gene modulation and immune evasion strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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