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Enregistrement W1987895874 · doi:10.1097/hjh.0b013e3282f85ded

Submegabase resolution of epistatically interacting quantitative trait loci for blood pressure applicable for essential hypertension

2008· article· en· W1987895874 sur OpenAlexaff
Cristina Chauvet, Sophie Charron, Annie Ménard, Chunjie Xiao, Julie Roy, Alan Y. Deng

Notice bibliographique

RevueJournal of Hypertension · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenin-Angiotensin System Studies
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuantitative trait locusCongenicEpistasisPositional cloningGeneticsLocus (genetics)BiologyChromosomeTraitBlood pressureGeneCandidate geneGenetic architectureComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Although genetic mapping of quantitative trait loci for blood pressure to large chromosome segments is readily achievable, their final identification confronts formidable hurdles. Restriction of the genes lodging in one quantitative trait locus interval to experimental limitation can facilitate their positional cloning. We previously delineated several quantitative trait loci for blood pressure on chromosome 10 of Dahl salt-sensitive rats, but their chromosome delimitations were either large or not definitive. METHODS: In this study, we systematically and comprehensively constructed congenic strains with submegabase (Mb) genome resolution and analyzed their blood pressure by telemetry. RESULTS: Three quantitative trait loci have been conclusively delimited by three congenic strains, each independently lowering the blood pressure. Their intervals are demarcated by genomic regions between 350 and 910 kilobases (kb) in size. Two of the three quantitative trait loci share an epistatic relationship and are separated from one another by less than 170 kb. Two additional quantitative trait loci for blood pressure were also tentatively delineated and their intervals range from 520 kb to 1.75 Mb. Possible genes dwelling in each quantitative trait locus-interval number between 11 and 17. None of these genes is known to exert a functional impact on blood pressure. Work is underway to find candidate genes with mutations that could be responsible for the blood pressure effect. CONCLUSION: Novel diagnostic, prognostic, preventive and/or therapeutic targets for essential hypertension and hypertension-associated diseases are likely to emerge from the identification of these quantitative trait loci. Potential applications of these quantitative trait loci to humans are suggested from the positive results from several association studies, demonstrating the existence of quantitative trait loci in the broad homologous regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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