A <sup>2</sup>H NMR Relaxation Experiment for the Measurement of the Time Scale of Methyl Side-Chain Dynamics in Large Proteins
Notice bibliographique
Résumé
An NMR experiment is presented for the measurement of the time scale of methyl side-chain dynamics in proteins that are labeled with methyl groups of the (13)CHD(2) variety. The measurement is accomplished by selecting a magnetization mode that to excellent approximation relaxes in a single-exponential manner with a T(1)-like rate. The combination of R(1)((13)CHD(2)) and R(2)((13)CHD(2)) (2)H relaxation rates facilitates the extraction of motional parameters from (13)CHD(2)-labeled proteins exclusively. The utility of the methodology is demonstrated with applications to proteins with tumbling times ranging from 2 ns (protein L, 7.5 kDa, 45 degrees C) to 54 ns (malate synthase G, 82 kDa, 37 degrees C); dynamics parameters are shown to be in excellent agreement with those obtained in (2)H NMR studies of other methyl isotopomers. A consistency relationship is found to exist between R(1)((13)CHD(2)) and the relaxation rates of pure longitudinal and quadrupolar order modes in (13)CH(2)D-labeled methyl groups, and experimental rates measured for a number of proteins are shown to be in excellent agreement with expectations based on theory. The present methodology extends the applicability of (2)H relaxation methods for the quantification of side-chain dynamics in high molecular weight proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».