Gene methylation and silencing of <i><scp>SOCS</scp>3</i> in mantle cell lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
The significance of loss of SOCS3, a negative regulator of signalling pathways including those of STAT3 and NF-κB, was examined in mantle cell lymphoma (MCL). The protein expression and gene methylation status of SOCS3 were detected using immunohistochemistry/Western blots and methylation-specific polymerase chain reaction, respectively. To evaluate its functional importance, SOCS3 was restored in two SOCS3-negative MCL cell lines using a lentiviral vector. Loss of SOCS3 protein expression was found in 3/4 MCL cell lines and 18/33 (54.5%) tumours. SOCS3 was found consistently methylated in cell lines (3/4) and tumours (7/7) negative for SOCS3, and was unmethylated in all SOCS3-positive cell line (1/1) and tumours (5/5) examined. Treatment of all three SOCS3-negative cell lines with 2'-deoxy-5-azacytidine restored SOCS3 expression. SOCS3 is biologically important in MCL, as lentiviral transfer of SOCS3 in SOCS3-negative cell lines increased their apoptotic activity, downregulated nuclear factor (NF)-κB-p65, cyclin D1 (CCND1), BCL2 and BCL-XL (BCL2L1), and substantially dampened interleukin 10-induced STAT3 activation. In 19 patients aged ≤ 69 years at time of diagnosis, we found that those that carried SOCS3-negative tumours showed a trend toward a worse outcome (P = 0.1, log-rank).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».