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Enregistrement W1988378085 · doi:10.1615/critreveukargeneexpr.v22.i2.70

PAX Proteins and Fables of Their Reconstruction

2012· review· en· W1988378085 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueCritical Reviews in Eukaryotic Gene Expression · 2012
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomeoboxBiologyRNA splicingAlternative splicingComputational biologyGeneticsGeneHomology (biology)Protein domainDNAEvolutionary biologyGene duplicationGene isoformRNAGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The PAX proteins derive their name from the "paired box," a region of homology first described between the Drosophila paired (Prd) and gooseberry (Gsb) proteins and later found to encode a sequence-specific DNA-binding activity. Both Prd and Gsb also contain a homeodomain, and this combination of DNA-binding domains is conserved in ancestral predecessors, reflecting an early "homeodomain-capturing" event. In addition, the prototypic PAX protein was thought to contain 2 additional features, namely the octapeptide (or eh1) motif and PHT (or OAR) domain-both modulate PAX regulatory activity but are not unique to the PAX family. Together with gene duplications and mutagenesis, a domain loss model accounts for the distinct architecture and sequence of extant PAX proteins. Despite the disparate evolutionary history of these 4 conserved motifs, there is a remarkable level of interplay that is modulated by discrete sequences elsewhere in the protein. Here, the implications with respect to the evolution of PAX protein structure and activity are discussed, it is suggested that the sum of these constituent domains is more than the contribution of individual parts. When combined with alternative splicing and posttranslational modifications, this model confers an extraordinary degree of functional diversity to even highly related PAX proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,972
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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