PAX Proteins and Fables of Their Reconstruction
Notice bibliographique
Résumé
The PAX proteins derive their name from the "paired box," a region of homology first described between the Drosophila paired (Prd) and gooseberry (Gsb) proteins and later found to encode a sequence-specific DNA-binding activity. Both Prd and Gsb also contain a homeodomain, and this combination of DNA-binding domains is conserved in ancestral predecessors, reflecting an early "homeodomain-capturing" event. In addition, the prototypic PAX protein was thought to contain 2 additional features, namely the octapeptide (or eh1) motif and PHT (or OAR) domain-both modulate PAX regulatory activity but are not unique to the PAX family. Together with gene duplications and mutagenesis, a domain loss model accounts for the distinct architecture and sequence of extant PAX proteins. Despite the disparate evolutionary history of these 4 conserved motifs, there is a remarkable level of interplay that is modulated by discrete sequences elsewhere in the protein. Here, the implications with respect to the evolution of PAX protein structure and activity are discussed, it is suggested that the sum of these constituent domains is more than the contribution of individual parts. When combined with alternative splicing and posttranslational modifications, this model confers an extraordinary degree of functional diversity to even highly related PAX proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».