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Enregistrement W1988392464 · doi:10.1055/s-2009-1216437

Integration of Gene-to-Metabolite Networks for Understanding Global Responses of Phenolic Acids Biosynthesis in Salvia miltiorrhiza

2009· article· en· W1988392464 sur OpenAlexfundno aff
Yibo Xiao, Bo Yi, YB Duan, JF Chen, Yeman Liu, WS Chen, L Lei Zhang

Notice bibliographique

RevuePlanta Medica · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseAgricultural Research ServiceUniversity of British ColumbiaUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignChinese Academy of SciencesKurukshetra UniversityUniversity of Illinois at ChicagoNational Oceanic and Atmospheric AdministrationU.S. Food and Drug AdministrationNational Science Foundation of Sri LankaUniversity of ColomboU.S. Department of AgricultureWestern Carolina UniversityInternational Science CouncilNational Center for Complementary and Alternative MedicineChina Academy of Traditional Chinese MedicineNational Institutes of HealthNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesTürkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma KurumuHong Kong Polytechnic UniversityNational Science FoundationDeutsche KrebshilfeNational Natural Science Foundation of ChinaTata TrustsUniversity Grants CommissionWake Forest University
Mots-clésSalvia miltiorrhizaRosmarinic acidMethyl jasmonateMetabolomicsBiosynthesisMetabolic engineeringMetaboliteMetabolic pathwayBiologyBiochemistryTraditional medicineGeneComputational biologyChemistryTraditional Chinese medicineMedicineAntioxidantBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salvia miltiorrhiza Bunge, named “Dan-Shen” in Chinese as a traditional Chinese medicine, is used for improving body function, as well as for cardiac symptoms treatment for hundreds of years in China. The phenolic acids such as rosmarinic acid (RA) and its derivative lithospermic acid B (LAB) aroused scientists' interest in the last twenty years because of their notable pharmacological activities [1]. In our present study, abiotic elicitors such as methyl jasmonate (MeJA) and Ag + were found to enhance the phenolic acids at various levels. Meantime, based on the profiling changes of several related gene transcripts and metabolites (intermediates) accumulations, in response to elicitors, a gene-to-metabolite network for understanding of global responses to abiotic elicitation in S. miltiorrhiza is established (1), and a potential (putative) biosynthesis process form RA to LAB was presumed (2), which prompted the possibility of a key gene-based metabolic engineering for the synthesis of active pharmaceutical compounds in S. miltiorrhiza , and would certainly help us to globally and deeply understand metabolic flux of RA synthesis, both at stressed-elicitation and genetic-regulation levels. Acknowledgements : This research was financially supported by National Natural Science Foundation of China (20572130, 30600807). References: [1] Liu AH, et al. (2006) J Pharm Biomed Anal, 41: 48–56.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
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