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Enregistrement W1988819052 · doi:10.1074/jbc.m206677200

The Molecular Determinants of Ionic Regulatory Differences between Brain and Kidney Na+/Ca2+ Exchanger (NCX1) Isoforms

2002· article· en· W1988819052 sur OpenAlexafffund
Jeremy Dunn, Chadwick L. Elias, Hoa Dinh Le, Alexander Omelchenko, Larry V. Hryshko, Jonathan Lytton

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of ManitobaSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche MédicaleHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGene isoformSodium-calcium exchangerIonic bondingChemistryKidneyBiophysicsNeuroscienceBiochemistryInternal medicineBiologyMedicineGeneIonIntracellularOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Na(+)/Ca(2+) exchanger gene NCX1 undergoes alternative splicing leading to several isoforms that differ in a small portion of the large cytoplasmic loop. This loop is involved in many regulatory processes of NCX1, including ionic regulation by the transported substrates Na(+) and Ca(2+). High intracellular Ca(2+) can alleviate intracellular Na(+)-dependent inactivation in exon A (NCX1.4)-containing isoforms but not in those containing the mutually exclusive exon B (NCX1.3). Giant excised patches from Xenopus oocytes expressing various NCX1 constructs were used to examine the specific amino acids responsible for these observed regulatory differences. Using a chimeric approach, the region responsible was narrowed down to the small central part of exon A (IDDEEYEKNKTF). Replacing the second aspartic acid of this sequence with arginine (the corresponding amino acid in exon B) in an exon A background completely prevented the effect of Ca(2+) on intracellular Na(+)-dependent inactivation. Mutating the second lysine to cysteine (exon B) had a similar, but only partial, effect. The converse double mutant, but neither single mutation alone, introduced into an exon B background (arginine to aspartic acid and cysteine to lysine) was able to restore the NCX1.4 regulatory phenotype. These data demonstrate that aspartic acid 610 and lysine 617 (using the rat NCX1.4 numbering scheme) are critical molecular determinants of the unique Ca(2+) regulatory properties of NCX1.4.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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