Molecular evidence that <i>Verticillium ablo‐atrum</i> Grp 2 isolates are distinct from <i>V. albo‐atrum</i> Grp 1 and <i>V. tricorpus</i>
Notice bibliographique
Résumé
summary Verticillium species-specific primers were used in a polymerase chain reaction to differentiate between Verticillium albo-atrum groups and V. tricorpus. Amplification with species-specific primers identified 21 isolates from the 64 V. albo-atrum isolates tested as Grp2. Genome analysis using RAPDs and restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the intergenic (IGS) region of the rDNA showed that V. albo-atrum Grp2 isolate were genetically distinct from either V. albo-atrum Grp1 or V. tricorpus, demonstrating a significant differentiation between these species. The sizes of the amplified IGS fragment were different, with Grp1 isolates having a smaller fragment ( approximately 2.1 kb) than either Grp2 ( approximately 2.3 kb) or V. tricorpus ( approximately 2.7 kb). Based on RAPD analysis, the average similarity coefficients between Grp1 and Grp2 were 35% and 34% between Grp2 and V. tricorpus. Multiple correspondence analysis separated the isolates into three major groups corresponding to Grp1, Grp2 and V. tricorpus. Surprisingly, isolates collected from Pisum sativa were distinct from other Grp1 V. albo-atrum isolates. The observed low levels of genetic similarity, the differences in sizes of IGS fragments, IGS-RFLP profiles and the RAPD patterns point to the possibility of Grp2 isolates comprising a different species of Verticillium than those occupied by either V. albo-atrum Grp1 isolates or V. tricorpus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».