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Enregistrement W1990236719 · doi:10.1158/0008-5472.can-05-2516

Melanosomal Targeting Sequences from gp100 Are Essential for MHC Class II–Restricted Endogenous Epitope Presentation and Mobilization to Endosomal Compartments

2006· article· en· W1990236719 sur OpenAlexaff
Stéphanie Lepage, Réjean Lapointe

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalHôpital Notre-Dame
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMHC class IMHC class IIEndosomeBiologyCD74CD8MHC restrictionEpitopeAntigen presentationMajor histocompatibility complexAntigenCell biologyCross-presentationAntigen processingT cellImmunologyImmune systemIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD4+ T lymphocytes play an important role in CD8+ T cell-mediated responses against tumors. Considering that approximately 20% of melanomas express MHC class II, it is plausible that concomitant presentation by MHC class I and class II shapes positive (helper T cells) or negative (regulatory T cells) antitumor responses. Interestingly, gp100, a melanoma antigen, can be presented by both MHC class I and class II when expressed endogenously, suggesting that it can reach endosomal/MHC class II compartments (MIIC). Here, we showed that gp100 putative NH2-terminal signal sequence and the last 70 residues in COOH terminus are essential for MIIC localization and MHC class II presentation. Confocal microscopy analyses confirmed that gp100 was localized in LAMP-1+/HLA-DR+ endosomal/MIIC. Gp100 targeting sequences were characterized by deleting different sections in the COOH terminus (last 70 residues). Transfection in 293T cells, expressing MHC class I and class II molecules, revealed that specific deletions in COOH terminus resulted in decreased MHC class II presentation, without effects on class I presentation, suggesting a role in MIIC trafficking for these deleted sections. Then, we used these gp100 targeting sequences to mobilize green fluorescent protein to endosomal compartments and to allow MHC class II and class I presentation of minimal endogenous epitopes. We conclude that these specific sequences are MIIC-targeting motifs, which could be included in expression cassettes for endogenously expressed tumor or viral antigens for MHC class II and class I presentation and optimize in vivo T-cell responses or as an in vitro tool for characterization of new MHC class II epitopes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,883

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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