MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1990574610 · doi:10.1002/cbic.201200619

A Synthetic, Species‐Specific Activator of Secondary Metabolism and Sporulation in <i>Streptomyces coelicolor</i>

2012· article· en· W1990574610 sur OpenAlexafffund
Salman Ahmed, Arryn Craney, Sheila Marie Pimentel‐Elardo, Justin R. Nodwell

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSecondary metabolismStreptomyces coelicolorStreptomycesActinomycetalesBiochemistryMetabolismBiologySmall moleculeStreptomycetaceaeActinorhodinBacteriaSecondary metaboliteMicrobial metabolismBiosynthesisComputational biologyChemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The secondary metabolites produced by bacterial species serve many clinically useful purposes, and Streptomyces have been an abundant source of such compounds. However, a poor understanding of their regulatory cascades leads to an inability to isolate all of the secondary metabolites this genus is capable of producing. This study focuses on comparing synthetic small molecules that were found to alter the production of secondary metabolites in Streptomyces coelicolor. A survey of these molecules suggests that each has a distinct mechanism of action, and hence, could be used as a unique probe of secondary metabolism. A comparative analysis of two of these molecules, ARC2 and ARC6, confirmed that they modulate secondary metabolites in different ways. In a separate study, ARC2 was shown to give rise to a different phenotype through the inhibition of a target in fatty acid biosynthesis. The results of this study suggest that ARC6 does not have the same target, although it might target the same metabolic system. Furthermore, the results demonstrate that ARC2 and ARC6 act through distinct mechanisms and further suggest that chemical probes can be important tools in enhancing our understanding of secondary metabolism and the streptomycete life cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueChemBioChemMême sujetMicrobial Natural Products and BiosynthesisTravaux en français237 207