Differentiation and molecular detection of Canadian necrotic strains of<i>Potato virus Y</i>
Notice bibliographique
Résumé
Isolates of Potato virus Y (PVY) from potatoes grown in Canada were identified as tuber necrotic strains on the basis of biological, serological, and molecular characteristics. Only one isolate, however, caused symptoms of potato tuber necrotic ringspot disease (PTNRD) in progeny tubers of inoculated potato plants Solanum tuberosum 'Nadine' under greenhouse conditions. None of the isolates caused symptoms of PTNRD in potato plants 'Russet Burbank' or 'Saco'. A primer set based on the NIb gene for detection of PVYO by RT-PCR was modified to include detection of the Canadian necrotic isolates of PVY. Restriction analysis of amplicons generated from suspected PVYNTN isolates with primers based on the P1 protein gene differentiated two sets of isolates. Subsequent comparison of the P1 gene sequence of the Canadian isolates with published sequences confirmed that the isolates corresponded to North American and European types of PVYNTN. A new primer pair, based on the NIb gene sequence amplified by RT-PCR, allowed the amplification by RT-PCR of a gene fragment from all PVYN and PVYNTN isolates but not from PVYO strains. These primers proved to be useful for detecting the virus in composite samples of potato leaves, sprouts, and tubers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».