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Enregistrement W1990787326 · doi:10.1080/07060660509507203

Differentiation and molecular detection of Canadian necrotic strains of<i>Potato virus Y</i>

2005· article· en· W1990787326 sur OpenAlexaffvenueabout
Huimin Xu, J. Nie, S. H. De Boer

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPotato virus YBiologyAmpliconPrimer (cosmetics)GenePotyvirusSolanum tuberosumPolymerase chain reactionVirologySerologyVirusInoculationPlant virusBotanyGeneticsHorticultureAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Isolates of Potato virus Y (PVY) from potatoes grown in Canada were identified as tuber necrotic strains on the basis of biological, serological, and molecular characteristics. Only one isolate, however, caused symptoms of potato tuber necrotic ringspot disease (PTNRD) in progeny tubers of inoculated potato plants Solanum tuberosum 'Nadine' under greenhouse conditions. None of the isolates caused symptoms of PTNRD in potato plants 'Russet Burbank' or 'Saco'. A primer set based on the NIb gene for detection of PVYO by RT-PCR was modified to include detection of the Canadian necrotic isolates of PVY. Restriction analysis of amplicons generated from suspected PVYNTN isolates with primers based on the P1 protein gene differentiated two sets of isolates. Subsequent comparison of the P1 gene sequence of the Canadian isolates with published sequences confirmed that the isolates corresponded to North American and European types of PVYNTN. A new primer pair, based on the NIb gene sequence amplified by RT-PCR, allowed the amplification by RT-PCR of a gene fragment from all PVYN and PVYNTN isolates but not from PVYO strains. These primers proved to be useful for detecting the virus in composite samples of potato leaves, sprouts, and tubers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,835
Score d'incertitude au seuil0,868

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2005
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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