MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1991031899 · doi:10.1074/jbc.m104387200

Identification of Inactivation Determinants in the Domain IIS6 Region of High Voltage-activated Calcium Channels

2001· article· en· W1991031899 sur OpenAlexaff
Stephanie C. Stotz, Gerald W. Zamponi

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIdentification (biology)CalciumVoltage-dependent calcium channelDomain (mathematical analysis)ChemistryCell biologyBiologyMathematicsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have recently reported that transfer of the domain IIS6 region from rapidly inactivating R-type (alpha(1E)) calcium channels to slowly inactivating L-type (alpha(1C)) calcium channel confers rapid inactivation (Stotz, S. C., Hamid, J., Spaetgens, R. L., Jarvis, S. E., and Zamponi, G. W. (2000) J. Biol. Chem. 275, 24575-24582). Here we have identified individual amino acid residues in the IIS6 regions that are responsible for these effects. In this region, alpha(1C) and alpha(1E) channels differ in seven residues, and exchanging five of those residues individually or in combination did not significantly affect inactivation kinetics. By contrast, replacement of residues Phe-823 or Ile-829 of alpha(1C) with the corresponding alpha(1E) residues significantly accelerated inactivation rates and, when substituted concomitantly, approached the rapid inactivation kinetics of R-type channels. A systematic substitution of these residues with a series of other amino acids revealed that decreasing side chain size at position 823 accelerates inactivation, whereas a dependence of the inactivation kinetics on the degree of hydrophobicity could be observed at position 829. Although these point mutations facilitated rapid entry into the inactivated state of the channel, they had little to no effect on the rate of recovery from inactivation. This suggests that the development of and recovery from inactivation are governed by separate structural determinants. Finally, the effects of mutations that accelerated alpha(1C) inactivation could still be antagonized following coexpression of the rat beta(2a) subunit or by domain I-II linker substitutions that produce ultra slow inactivation of wild type channels, indicating that the inactivation kinetics seen with the mutants remain subject to regulation by the domain I-II linker. Overall, our results provide novel insights into a complex process underlying calcium channel inactivation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetIon channel regulation and functionTravaux en français237 207