Evolution of the Eukaryotic Translation Termination System: Origins of Release Factors
Notice bibliographique
Résumé
Accurate translation termination is essential for cell viability. In eukaryotes, this process is strictly maintained by two proteins, eukaryotic release factor 1 (eRF1), which recognizes all stop codons and hydrolyzes peptidyl-tRNA, and eukaryotic release factor 3 (eRF3), which is an elongation factor 1alpha (EF-1alpha) homolog stimulating eRF1 activity. To retrace the evolution of this core system, we cloned and sequenced the eRF3 genes from Trichomonas vaginalis (Parabasalia) and Giardia lamblia (Diplomonada), which are generally thought to be "early-diverging eukaryotes," as well as those from two ciliates (Oxytricha trifallax and Euplotes aediculatus). We also determined the sequence of the eRF1 gene for G. lamblia. Surprisingly, the G. lamblia eRF3 appears to have only one domain, corresponding to EF-1alpha, while other eRF3s (including the T. vaginalis protein) have an additional N-terminal domain, of 66-411 amino acids. Considering this novel eRF3 structure and our extensive phylogenetic analyses, we suggest that (1) the current translation termination system in eukaryotes evolved from the archaea-like version, (2) eRF3 was introduced into the system prior to the divergence of extant eukaryotes, including G. lamblia, and (3) G. lamblia might be the first eukaryotic branch among the organisms considered.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».