SP1 regulates a human <i>SNAP‐25</i> gene expression
Notice bibliographique
Résumé
The synaptosomal-associated protein of 25 kDa (SNAP-25) is a pre-synaptic plasma membrane protein. SNAP-25 plays an important role in synaptic vesicle membrane docking and fusion, which is involved in the regulation of neurotransmitter release. SNAP-25 has been implicated in the pathogenesis of neuropsychiatric disorders including Schizophrenia, attention-deficit hyperactivity disorder and Alzheimer's disease. We cloned a 1584 bp segment of the 5' flanking region of the human SNAP-25 gene. A series of nested deletions of the 5' flanking region fragment were subcloned into the pGL3-basic luciferase reporter plasmid. N2A cells were transfected with the SNAP-25 promoter constructs and luciferase activity was measured as an indication of promoter activity. We identified a 188 bp fragment containing the transcription initiation site as the minimal region necessary for promoter activity. Several putative cis-acting elements including SP1, hypoxia inducible factor (HIF), cAMP-response element binding protein, T-cell factor/lymphocyte enhancer factor 1 (TCF/LEF1), AP1 and the signal transducer and activator of transcription-6 (STAT6) are found in the 5' flanking region of SNAP-25 gene. Transcriptional activation and gel shift assays showed that the human SNAP-25 gene promoter contains functional SP1 response elements. Over-expression of SP1 increased SNAP-25 gene expression and inhibition of SP1-mediated transcriptional activation reduced SNAP-25 gene expression. These results suggest that SP1 plays an important role in regulation of the human SNAP-25 gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».