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Enregistrement W1991613431 · doi:10.1111/j.1471-4159.2007.05167.x

SP1 regulates a human <i>SNAP‐25</i> gene expression

2007· article· en· W1991613431 sur OpenAlexaff
Fang Cai, Bin Chen, Weihui Zhou, Odysseus Zis, Shengchun Liu, Robert A. Holt, William G. Honer, Weihong Song

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnhancerBiologyMolecular biologyReporter geneAP-1 transcription factorGene expressionSp1 transcription factorTranscription factorActivator (genetics)5' flanking regionGeneTransfectionTranscription (linguistics)Regulation of gene expressionElectrophoretic mobility shift assayPromoterGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The synaptosomal-associated protein of 25 kDa (SNAP-25) is a pre-synaptic plasma membrane protein. SNAP-25 plays an important role in synaptic vesicle membrane docking and fusion, which is involved in the regulation of neurotransmitter release. SNAP-25 has been implicated in the pathogenesis of neuropsychiatric disorders including Schizophrenia, attention-deficit hyperactivity disorder and Alzheimer's disease. We cloned a 1584 bp segment of the 5' flanking region of the human SNAP-25 gene. A series of nested deletions of the 5' flanking region fragment were subcloned into the pGL3-basic luciferase reporter plasmid. N2A cells were transfected with the SNAP-25 promoter constructs and luciferase activity was measured as an indication of promoter activity. We identified a 188 bp fragment containing the transcription initiation site as the minimal region necessary for promoter activity. Several putative cis-acting elements including SP1, hypoxia inducible factor (HIF), cAMP-response element binding protein, T-cell factor/lymphocyte enhancer factor 1 (TCF/LEF1), AP1 and the signal transducer and activator of transcription-6 (STAT6) are found in the 5' flanking region of SNAP-25 gene. Transcriptional activation and gel shift assays showed that the human SNAP-25 gene promoter contains functional SP1 response elements. Over-expression of SP1 increased SNAP-25 gene expression and inhibition of SP1-mediated transcriptional activation reduced SNAP-25 gene expression. These results suggest that SP1 plays an important role in regulation of the human SNAP-25 gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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