<i>DPP4</i>Gene DNA Methylation in the Omentum is Associated With Its Gene Expression and Plasma Lipid Profile in Severe Obesity
Notice bibliographique
Résumé
Severely obese subjects with the metabolic syndrome (MS) have higher dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) expression in their visceral adipose tissue (VAT) compared to obese individuals without MS. We tested the hypothesis that methylation level of CpG sites in the DPP4 promoter CpG island in VAT was genotype-dependent and associated with DPP4 mRNA abundance and MS-related phenotypes. The VAT DNA was extracted in 92 severely obese premenopausal women undergoing biliopancreatic derivation for the treatment of obesity. Women were nondiabetic and none of them used medication to treat MS features. Cytosine methylation rates (%) of 102 CpG sites in the DPP4 CpG island were assessed by pyrosequencing of sodium bisulfite-treated DNA. Methylation rates were >10% for CpG sites 94-102. Their mean methylation rate (%Meth(94-102)) was different between genotypes for DPP4 polymorphisms rs13015258 (P = 0.001), rs17848915 (P = 0.0004), and c.1926 G>A (P = 0.001). The %Meth(94-102) correlated negatively with DPP4 mRNA abundance (r = -0.25, P < 0.05) and positively with plasma high-density lipoprotein (HDL) cholesterol concentrations (r = 0.22, P < 0.05), whereas DPP4 mRNA abundance correlated positively with plasma total-/HDL-cholesterol ratio (r = 0.25; P < 0.05). In the VAT of nondiabetic severely obese women, genotype-dependent methylation levels of specific CpG sites in the DPP4 promoter CpG island were associated with DPP4 gene expression and variability in the plasma lipid profile. Higher DPP4 gene expression in VAT and its relationship with the plasma lipid profile may be explained by actually unknown DPP4 biological effect or, to another extent, may also be a marker of VAT inflammation known to be associated with metabolic disturbances.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».