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Enregistrement W1992575516 · doi:10.1074/jbc.m701735200

Residues 334 and 338 in Transmembrane Segment 8 of Human Equilibrative Nucleoside Transporter 1 Are Important Determinants of Inhibitor Sensitivity, Protein Folding, and Catalytic Turnover

2007· article· en· W1992575516 sur OpenAlexaff
Frank Visser, Lijie Sun, Vijaya L. Damaraju, Tracey Tackaberry, Yunshan Peng, Morris J. Robins, Stephen A. Baldwin, James D. Young, Carol E. Cass

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésNucleoside transporterNucleosideTransporterChemistryTransmembrane proteinSensitivity (control systems)Folding (DSP implementation)BiochemistryGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Equilibrative nucleoside transporters (ENTs) are important for the metabolic salvage of nucleosides and the cellular uptake of antineoplastic and antiviral nucleoside analogs. Human equilibrative nucleoside transporter 1 (hENT1) is inhibited by nanomolar concentrations of structurally diverse compounds, including dipyridamole, dilazep, nitrobenzylmercaptopurine ribonucleoside (NBMPR), draflazine, and soluflazine. Random mutagenesis and screening by functional complementation for inhibitor-resistant mutants in yeast revealed mutations at Phe-334 and Asn-338. Both residues are predicted to lie in transmembrane segment 8 (TM 8), which contains residues that are highly conserved in the ENT family. F334Y displayed increased V(max) values that were attributed to increased rates of catalytic turnover, and N338Q and N338C displayed altered membrane distributions that appeared to be because of protein folding defects. Mutations of Phe-334 or Asn-338 impaired interactions with dilazep and dipyridamole, whereas mutations of Asn-338 impaired interactions with draflazine and soluflazine. A helical wheel projection of TM 8 predicted that Phe-334 and Asn-338 lie in close proximity to other highly conserved and/or hydrophilic residues, suggesting that they form part of a structurally important region that influences interactions with inhibitors, protein folding, and rates of conformational change during the transport cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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