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Enregistrement W1993123531 · doi:10.1021/jp0759325

A Quantitative Scale for the Extent of Conjugation of the Amide Bond. Amidity Percentage as a Chemical Driving Force

2007· article· en· W1993123531 sur OpenAlexaff
Zoltán Mucsi, Alex Yi‐Lin Tsai, Milán Szöri, Gregory A. Chass, Béla Viskolcz, Imre G. Csizmadia

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueChemical Reaction Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmideChemistryAffinitiesEnthalpyNucleophileResonance (particle physics)Peptide bondComputational chemistryBond strengthReactivity (psychology)Chemical reactionThermodynamicsOrganic chemistryStereochemistryPhysicsAtomic physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The amide bond may be considered as one of the most important chemical building blocks, playing an important role not only in living organisms but in organic chemistry as well. The exact description and precise quantification of the amide bond strength is difficult, requiring a particular type of theoretical investigation. The present paper suggests a novel, yet simple, method toward quantifying amide bond strength on a linear scale, defined as the "amidity scale". This is achieved using the computed enthalpy of hydrogenation (DeltaHH2) of the compound examined. In the present conceptual work, the DeltaHH2 value for dimethylacetamide is used to define perfect amidic character (amidity=+100%), while azaadamantane-2-on represents complete absence of amidic character (amidity=0%). The component DeltaHH2 values were computed at differing levels of theory, providing a computational and quasi-"method-independent" measure of amidity. A total of 29 well-known amides were examined to demonstrate the "scoring" accuracy of this methodology. For the compounds examined, a correlation has been made between the computed amidity percentage and their common COSNAR resonance energy values, proton affinities, and reactivity in a nucleophilic addition reaction. Selected chemical reactions were also studied. It has been shown that the change of the amidity value, during acyl transfer reactions, represents a thermodynamic driving force for the reaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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