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Enregistrement W1993953131 · doi:10.1139/b07-038

Identification of the full-length <i>Hs1<sup>pro-1</sup></i> coding sequence and preliminary evaluation of soybean cyst nematode resistance in soybean transformed with <i>Hs1<sup>pro-1</sup></i> cDNA

2007· article· en· W1993953131 sur OpenAlexaffvenue
Michael D. McLean, Gordon J. Hoover, Bonnie Bancroft, Amina Makhmoudova, Shawn M. Clark, T. W. Welacky, Daina H. Simmonds, Barry J. Shelp

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensUniversity of GuelphAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSoybean cyst nematodeBiologySugar beetGeneCoding regionMolecular biologyPolymerase chain reactionGeneticsPotato cyst nematodeGenetically modified cropsNematodeTransgeneHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Hs1pro-1 gene reportedly confers resistance to the beet cyst nematode in wild beet and sugar beet. Here, we tested the hypothesis that Hs1pro-1 confers resistance in soybean against the soybean cyst nematode (SCN). The full-length Hs1pro-1 coding sequence, which encodes a predicted polypeptide of 490 amino acids, was first acquired then expressed in ‘Westag’ soybean using a constitutive octopine synthase – mannopine synthase promoter. Thirty T0 lines that successfully expressed the Hs1pro-1 gene, as indicated by both polymerase chain reaction and reverse transcriptase – polymerase chain reaction analyses, were generated. Bioassay of the T1 progeny from these lines revealed that only five T0 lines grew normally and exhibited a high degree of SCN resistance. On average, these T1 transgenic progeny were about 70% more resistant to SCN than susceptible control cultivars. These preliminary data suggest that Hs1pro-1 is a promising candidate for genetically engineering SCN resistance in elite, locally adapted soybean cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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