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Enregistrement W1994297595 · doi:10.1016/j.ymthe.2006.08.632

559. A Pseudo-Exon Derived from an Intronic Insertion Is Responsible for Duchenne-Like Muscular Dystrophy in the Welsh Corgi Dog

2006· article· en· W1994297595 sur OpenAlexaboutno aff
B. F. Smith

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDystrophinDuchenne muscular dystrophyMuscular dystrophyMuscle contractureExonNonsense mutationPopulationBiologyMedicinePathologyMutationInternal medicineGeneticsEndocrinologyMissense mutationAnatomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) is the most common X- linked inherited disease, with an incidence of 1 in 3500 male births. This disease is relentlessly progressive and usually fatal by early adulthood. A wide range of mutations in the dystrophin gene have been characterized for DMD, as well as the less severe form, Becker's Muscular Dystrophy. DMD presents gene therapy challenges due to the size of the gene and resulting cDNA and the wide variety and complexity of the mutations involved. Animal models for DMD have been described in the mouse, cat and dog. The disease in mice and cats is significantly less severe than that seen in humans, while the canine disease, characterized by muscle hypertrophy, followedby muscle loss, fibrosis and death, closely mimics disease progression in affected humans. As is expected from the frequency of mutation in the human population, DMD has been recognized in several breeds of dogs including the Golden Retriever, German Short-Haired Pointer, Rottweiler, Labrador Retriever, West Highland White and Welsh Corgi. Where the mutation has been determined, each breed has demonstrated a new mutation. Here we report the identification of the mutation responsible for DMD in the Welsh Corgi. Affected dogs can be recognized at, or shortly after, birth by increased serum creatine kinase levels. These dogs show progressive muscle atrophy and fibrosis, stunted growth, contractures and consequent debilitation. However, several of the affected males have lived to sexual maturity. Muscle biopsies from affected Corgis show that most fibers remain unstained for dystrophin, while rare fibers show dystrophin staining using a variety of antibodies. Sequence analysis of the cDNA indicates a 166 base insertion between exons 13 and 14, based on the human exon structure. The inserted sequence shows a high degree of sequence similarity to a canine LINE-1 element. Sequence analysis of intron 13, which is approximately 25kb, indicates that there is an insertion in the intron. The insertion is immediately downstream of an AG dinucleotide pair and contains the 166 bases seen in the cDNA followed by a GT dinucleotide pair and additional inserted sequence. Thus the insertion utilizes a putative intronic 3’ splice acceptor site and a 5’ splice donor to form a novel exon, which is spliced into the mature mRNA. An in-frame stop codon in this novel exon results in a truncated dystrophin protein, which is non-functional. Staining of occasional fibers with antibodies to epitopes located downstream of this insertion indicates that this exon may be skipped or that alternative splicing and/or promoter use may produce a product. This large animal model, with its defined mutation, will be useful in a variety of ways, including the use of gene repair approaches to skip the inserted exon, studies of spicing mechanisms in dystrophin, and studies of other gene therapy approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,130
Score d'incertitude au seuil0,833

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
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