Contribution de l’autophagie dans l’apprêtement d’antigènes viraux endogènes
Notice bibliographique
Résumé
M/S n° 11, vol. 25, novembre 2009 Xenophagie, immunite innee et immunite acquise L’autophagie designe le processus par lequel la cellule capture du materiel cytoplasmique afin de le degrader dans des lysosomes. Ce mecanisme permet notamment de recycler les constituants cellulaires et de maintenir l’homeostasie necessaire au bon fonctionnement de la cellule. Parallelement a sa fonction catabolique, l’autophagie joue un role capital dans differents mecanismes lies a l’immunite. Pour faire face a l’intrusion de micro-organismes pathogenes (bacteries, virus ou parasites), la cellule est en effet capable de detourner l’autophagie de son role primordial « d’usine de recyclage » afin de sequestrer l’envahisseur dans une double membrane et de le degrader [1]. Cette elimination des pathogenes par autophagie (appelee xenophagie) constitue un des fondements de l’immunite dite « innee » [2]. En revanche, l’etablissement d’un lien direct entre la xenophagie et l’immunite dite « acquise », c’est-a-dire une immunite specifique permettant d’eliminer le non-soi, a ete beaucoup plus recent. En effet, ce n’est qu’en 2005 que le groupe de Munz a montre que l’antigene viral EBNA (Epstein Barr virus nuclear antigen), une des proteines du virus Epstein Barr, pouvait etre transfere dans des autophagosomes et presente sur des molecules du complexe majeur d’histocompatibilite (CMH) de classe II [3]. Ces molecules du CMH de classe II sont pourtant classiquement decrites comme les responsables de la Contribution de l’autophagie dans l’appretement d’antigenes viraux endogenes
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».