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Enregistrement W1994375280 · doi:10.3201/eid1106.041146

Community-associated Methicillin-resistant<i>Staphylococcus aureus</i>, Canada

2005· article· en· W1994375280 sur OpenAlexaffabout
Michael R. Mulvey, Laura MacDougall, Brenda Cholin, Greg B. Horsman, Melanie Fidyk, Shirley Woods

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensSaskatchewan HealthBC Centre for Disease ControlHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMupirocinMethicillin-resistant Staphylococcus aureusStaphylococcus aureusPulsed-field gel electrophoresisMicrobiologySubtypingMultilocus sequence typingPanton–Valentine leukocidinCluster (spacecraft)Multiple drug resistanceStaphylococcal infectionsMedicineBiologyDrug resistanceGenotypeGeneBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A total of 184 methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains were collected from patients who sought treatment primarily for skin and soft tissue infections from January 1, 1999, to March 31, 2002, in east-central Saskatchewan, Canada.Molecular subtyping analysis using pulsed-field gel electrophoresis showed 2 major clusters.Cluster A (n = 55) was composed of a multidrug-resistant MRSA strain associated with a long-term care facility and was similar to the previously reported nosocomial Canadian epidemic strain labeled CMRSA-2.Cluster B (n = 125) was associated with cases identified at community health centers and was indistinguishable from a community-associated (CA)-MRSA strain identified previously in the United States (USA400).Cluster B remained susceptible to a number of classes of antimicrobial agents and harbored the lukF-PV and lukS-PV toxin genes.Over 50% of both clonal groups displayed high-level resistance to mupirocin.This is the first report of the USA400 strain harboring the lukF-PV and lukS-PV toxin genes in Canada.T he first report of a highly virulent community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) strain occurred in 1993 in Australia (1), and since that time CA-MRSA has been reported in many countries.CA-MRSA strains are different genetically and epidemiologically from strains commonly associated with nosocomial infections.Common nosocomial risk factors generally do not apply to CA-MRSA, although previous antimicrobial drug use has been identified as a potential risk factor for CA-MRSA (2-4).In addition, reports have documented CA-MRSA as having caused serious, and sometimes fatal, disease, especially in otherwise healthy children (5-7).Most CA-MRSA strains remain susceptible to a number of classes of antimicrobial agents such as aminoglycosides, tetracyclines, and fluoroquinolones.Many reports of CA-MRSA have described strains harboring the Panton-Valentine leukocidin determinant, a virulence factor for primary skin infection and pneumonia (8,9).Over the past decade, MRSA has been observed sporadically as a community-acquired pathogen in Canada (10,11).On the Canadian prairies a disproportionate number of aboriginal persons admitted to acute care facilities are infected or colonized with MRSA, compared to persons of nonaboriginal origin (10,12).This report describes the emergence of 2 different strains of MRSA in east-central Saskatchewan, Canada.The first was associated with a long-term care facility and the second was a clone of MRSA harboring the lukF-PV and lukS-PV toxin genes and generated an indistinguishable fingerprint from the previously described USA400 strain.This is the first report describing the emergence in Canada of the strain of USA400 that contains lukF-PV and lukS-PV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,086

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations135
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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