Use of the Expanded Panel of<scp>BXD</scp>Mice Narrow<scp>QTL</scp>Regions in Ethanol‐Induced Locomotor Activation and Motor Incoordination
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Alcohol-related responses are under strong genetic regulation. A wealth of alcohol-related data from recombinant inbred (RI) mouse strains enables genetic correlation and mapping of these traits. Previous studies using RI strains have identified numerous chromosomal locations that underlie differential alcohol sensitivity, although the regions identified are typically large. One means to improve power and precision for genetic analysis is to use a larger genetic reference population. The expanded panel of BXD RI mice was used to identify quantitative trait loci (QTLs) associated with sensitivity to locomotor stimulatory and motor incoordinating effects of alcohol. The goals of this study were to determine whether previously reported QTLs were replicated and refined and to determine whether novel QTLs would be identified. METHODS: Following an i.p. dose of 2.25 g/kg of ethanol (EtOH) or saline control, locomotor activation was assessed using an activity chamber and motor incoordination was assessed using the accelerating rotarod. Male and female BXD mice from over 55 strains were tested. Two treatment paradigms were utilized to evaluate the effects of EtOH versus saline treatment-order. RESULTS: Activity chamber measures showed significant differences in strain, sex, and treatment-order whereas rotarod measures showed significant differences in strain and treatment-order. Significant QTLs for various measures of EtOH-induced locomotor activation were identified on chromosomes 2 and 5 that narrowed QTL regions previously identified from 19 to < 2 Mb. Further, a novel significant QTL for EtOH-induced motor incoordination on chromosome 7 was identified. CONCLUSIONS: Using the expanded RI BXD panel, along with a high precision marker map, several novel QTLs were found and several previously identified QTL regions were confirmed and narrowed. The isogenic nature of the population facilitated detection of treatment-order and sex-specific differences. Smaller QTL regions reduced the number of positional candidates thereby increasing the efficiency with which polymorphisms underlying the QTL will be identified.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».