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Enregistrement W1994614361 · doi:10.2135/cropsci2009.06.0334

Association Mapping of Malting Quality Data from Western Canadian Two‐row Barley Cooperative Trials

2010· article· en· W1994614361 sur OpenAlexafffundabout
Aaron D. Beattie, Michael J. Edney, G. J. Scoles, B. G. Rossnagel

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesWestern Grains Research FoundationU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyHordeum vulgareTraitAssociation mappingGeneticsSelection (genetic algorithm)PopulationExpressed sequence tagAlleleQuantitative trait locusGeneBiotechnologyComputational biologyBotanyGenotypePoaceaeSingle-nucleotide polymorphismGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Re‐examining historical datasets is a proposed use for association mapping (AM) and is particularly valuable when the data describes time‐consuming and/or expensive to measure traits. A collection of 91 elite two‐row malting barley ( Hordeum vulgare L.) lines entered in the western Canadian Cooperative Two‐Row Barley Trials over a 13‐ yr period were analyzed by AM to identify markers associated with seven malting quality traits. A linear mixed‐model incorporating population structure and familial relatedness identified 27 diversity array technology (DArT) markers associated with malting quality. These markers will assist selection of parents with complementary allele combinations for future crosses and help identify progeny with the desired alleles. Putative candidate expressed sequence tags (ESTs) responsible for marker‐trait associations were identified for 19 of the 27 DArT markers and include genes important for seed storage protein accumulation, gibberellin‐mediated gene expression, seed storage mobilization, and dormancy. Efforts to identify novel variability in these genes may present opportunities to improve malting quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,833
Score d'incertitude au seuil0,884

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,150
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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