Quantitative study of persistence of human norovirus genome in water using TaqMan real-time RT-PCR
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: To evaluate the persistence of human norovirus (NoV) in different types of water at various temperatures using conventional and TaqMan real-time reverse transcription-PCR (RT-PCR). METHODS AND RESULTS: Water from different sources was spiked with NoV and incubated at different temperatures over a 3-month period. NoV viral RNA was amplified by one-step TaqMan real-time RT-PCR and by conventional two-step RT-PCR. NoV persisted in mineral and tap water for over 2 months at all tested temperatures but disappeared after 100 days. At 4 and -20 degrees C, viral degradation was slower than that at 25 degrees C. In river water and effluent from primary sewage treatment, a slight reduction in viral load was observed after 1 month at 4 degrees C. This is the first demonstration of medium-to-long-term survival of human NoVs in different types of water using TaqMan real-time detection. CONCLUSIONS: NoV genome may persist for long periods of time in different types of water. Quantitative TaqMan real-time RT-PCR is a sensitive system that allows accurate evaluation of the persistence of human NoVs in different water samples. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: Our study is one of the few to demonstrate the ability of NoV to survive for a long time in water.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».