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Enregistrement W1995013829 · doi:10.1097/fpc.0b013e32835d9b0b

The LCS6 polymorphism in the binding site of let-7 microRNA to the KRAS 3′-untranslated region

2013· article· en· W1995013829 sur OpenAlexaff
Ana Sebio, Laia Paré, David Páez, Juliana Salazar, Alan González, Núria Sala, Elisabeth del Río, Marta Martín-Richard, M. Tobeña, Agustí Barnadas, Montserrat Baiget

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensSaint Paul University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASColorectal cancerInternal medicineGenotypeMedicineOncologyAllelePharmacogeneticsChemotherapySingle-nucleotide polymorphismCancerBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Although KRAS mutation status has been identified as a strong predictor of response to anti-epidermal growth factor receptor (EGFR) therapies, not all wild-type patients respond. The lethal-7 (let-7) family of microRNAs regulates KRAS activity. A functional polymorphism (rs61764370) has been described in the let-7 complementary site (LCS6). We hypothesized a possible association between this KRAS let-7 LCS6 polymorphism and the response to anti-EGFR treatments in KRAS and BRAF wild-type metastatic colorectal cancer patients (mCRC). MATERIALS AND METHODS: We studied the association of the KRAS let-7 LCS6 polymorphism with the response in 100 refractory mCRC patients treated with anti-EGFR antibodies. To assess the real effect of this polymorphism in relation to the treatment administered, we also studied this association in an independent cohort of patients treated exclusively with chemotherapy. The KRAS let-7 LCS6 polymorphism was genotyped using the BioMark system in blood and tumor DNA samples. The BRAF V600E mutation was analyzed in tumor samples. RESULTS: The KRAS let-7 LCS6 G-allele showed a statistically significant association with nonresponse to anti-EGFR-based treatment: 31.9% of patients with the T/T genotype presented a complete or a partial response versus no patients with T/G or G/G genotypes (P=0.004). No statistically significant differences were observed in the patients who received chemotherapy only. CONCLUSION: These data support the pharmacogenetic role of the KRAS let-7 LCS6 polymorphism in predicting the efficacy of anti-EGFR-based therapy in mCRC patients with the KRAS and the BRAF wild-type genotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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