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Enregistrement W1995151136 · doi:10.1139/cjb-2014-0181

Genetic structure of the introduced heaven tree (<i>Ailanthus altissima</i>) in Japan: evidence for two distinct origins with limited admixture

2014· article· en· W1995151136 sur OpenAlexvenueno aff
Hiroyuki Kurokochi, Yoko Saito, Yuji Ide

Notice bibliographique

RevueBotany · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésAilanthus altissimaBiologyGenetic structureLocus (genetics)Lineage (genetic)MicrosatelliteBotanyHaplotypeAnalysis of molecular varianceGenetic variationAlleleGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The heaven tree, Ailanthus altissima (Mill.) Swingle, was intentionally introduced from China to many temperate areas globally, where it has become successfully established. Here, we investigated the patterns of genetic differentiation between introduced Japanese A. altissima populations using both plastid and nuclear microsatellite markers. Three hundred and eighty-eight trees were sampled from six planted and 12 naturalized populations. Two distinct chloroplastic haplotypes were observed, which allowed us to separate two groups of trees, H1 and H3, containing 128 and 260 trees, respectively. Nine nuclear genetic microsatellites revealed 17.7 alleles per locus on average. These data did not indicate significant isolation-by-distance. Analysis of molecular variance showed the absence of genetic differentiation between the planted and naturalized populations. In contrast, the two groups defined according to the chloroplastic haplotypes (H1 and H3) were differentiated. STRUCTURE analysis showed that, within each haplotype group, most trees were strictly assigned to one cluster, with the exception of a few (ca. 30) trees. Our results indicate that (1) geographical genetic structure was weak, with high genetic variation among populations; (2) a congruent signal was revealed by chloroplastic and nuclear markers, indicating two distinct provenances; and (3) admixture between the two lineages has occurred, but remains limited. Several other invasive plant species have already been reported to exhibit similar trends; hence, future management of A. altissima might be required in Japan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,649
Score d'incertitude au seuil0,449

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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