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Enregistrement W1995194492 · doi:10.1139/o01-142

Biology of the prion gene complex

2001· review· en· W1995194492 sur OpenAlexafffundvenue
Peter Mastrangelo, David Westaway

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2001
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlzheimer Society
Mots-clésPRNPBiologyGeneGeneticsScrapieCoding regionBovine spongiform encephalopathyVirologyFYNPoint mutationCell biologyMutationPrion proteinSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The prion protein gene Prnp encodes PrPSc, the major structural component of prions, infectious pathogens causing a number of disorders including scrapie and bovine spongiform encephalopathy (BSE). Missense mutations in the human Prnp gene, PRNP, cause inherited prion diseases such as familial Creutzfeldt-Jakob Disease. In uninfected animals, Prnp encodes a GPI-anchored protein denoted PrPC, and in prion infections, PrPC is converted to PrPSc by templated refolding. Although Prnp is conserved in mammalian species, attempts to verify interactions of putative PrP-binding proteins by genetic means have proven frustrating in that two independent lines of Prnp gene ablated mice (Prnp0/0 mice: ZrchI and Npu) lacking PrPC remain healthy throughout development. This indicates that PrPC serves a function that is not apparent in a laboratory setting or that other molecules have overlapping functions. Shuttling or sequestration of synaptic Cu(II) via binding to N-terminal octapeptide residues and (or) signal transduction involving the fyn kinase are possibilities currently under consideration. A new point of entry into the issue of prion protein function has emerged from identification of a paralog, Prnd, with 25% coding sequence identity to Prnp. Prnd lies downstream of Prnp and encodes the Dpl protein. Like PrPC, Dpl is presented on the cell surface via a GPI anchor and has three alpha-helices: however, it lacks the conformationally plastic and octapeptide repeat domains present in its well-known relative. Interestingly, Dpl is overexpressed in two other lines of Prnp0/0 mice (Ngsk and Rcm0) via intergenic splicing events. These lines of Prnp0/0 mice exhibit ataxia and apoptosis of cerebellar cells, indicating that ectopic synthesis of Dpl protein is toxic to CNS neurons: this inference has now been confirmed by the construction of transgenic mice expressing Dpl under the direct control of the PrP promoter. Remarkably, Dpl-programmed ataxia is rescued by wt Prnp transgenes. The interaction between the Prnp and Prnd genes in mouse cerebellar neurons may have a physical correlate in competition between Dpl and PrPC within a common biochemical pathway that, when misregulated, leads to apoptosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2001
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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