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Enregistrement W1995357525 · doi:10.1021/bi050519d

NmerA, the Metal Binding Domain of Mercuric Ion Reductase, Removes Hg<sup>2+</sup> from Proteins, Delivers It to the Catalytic Core, and Protects Cells under Glutathione-Depleted Conditions<sup>,</sup>

2005· article· en· W1995357525 sur OpenAlex
Richard Ledwidge, Bijal Patel, Aiping Dong, David Fiedler, Mat Falkowski, Jane Zelikova, Anne O. Summers, E.F. Pai, Susan M. Miller

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMercury impact and mitigation studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Center for Research Resources
Mots-clésCatalysisChemistryGlutathioneThioredoxinMetalMetal ions in aqueous solutionThioredoxin reductaseIntracellularEscherichia coliBiophysicsStereochemistryBiochemistryEnzymeBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ligand binding and catalytic properties of heavy metal ions have led to the evolution of metal ion-specific pathways for control of their intracellular trafficking and/or elimination. Small MW proteins/domains containing a GMTCXXC metal binding motif in a betaalphabetabetaalphabeta fold are common among proteins controlling the mobility of soft metal ions such as Cu(1+), Zn(2+), and Hg(2+), and the functions of several have been established. In bacterial mercuric ion reductases (MerA), which catalyze reduction of Hg(2+) to Hg(0) as a means of detoxification, one or two repeats of sequences with this fold are highly conserved as N-terminal domains (NmerA) of uncertain function. To simplify functional analysis of NmerA, we cloned and expressed the domain and catalytic core of Tn501 MerA as separate proteins. In this paper, we show Tn501 NmerA to be a stable, soluble protein that binds 1 Hg(2+)/domain and delivers it to the catalytic core at kinetically competent rates. Comparison of steady-state data for full-length versus catalytic core MerA using Hg(glutathione)(2) or Hg(thioredoxin) as substrate demonstrates that the NmerA domain does participate in acquisition and delivery of Hg(2+) to the catalytic core during the reduction catalyzed by full-length MerA, particularly when Hg(2+) is bound to a protein. Finally, comparison of growth curves for glutathione-depleted Escherichia coli expressing either catalytic core, full-length, or a combination of core plus NmerA shows an increased protection of cells against Hg(2+) in the media when NmerA is present, providing the first evidence of a functional role for this highly conserved domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,762

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle