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Enregistrement W1995439954 · doi:10.1039/c2an35507h

Comparative study using Raman microspectroscopy reveals spectral signatures of human induced pluripotent cells more closely resemble those from human embryonic stem cells than those from differentiated cells

2012· article· en· W1995439954 sur OpenAlexafffund
Yan Zhi Tan, S. O. Konorov, H. Georg Schulze, James M. Piret, Michael W. Blades, Robin F. B. Turner

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesBritish Columbia Knowledge Development FundCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEmbryonic stem cellInduced pluripotent stem cellRaman microspectroscopyCell biologyHuman Induced Pluripotent Stem CellsChemistryBiologyRaman spectroscopyMolecular biologyBiochemistryGenePhysicsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Raman microspectroscopy is a non-destructive, label-free optical technique that offers information-rich molecular analysis of living cells. We report here the first Raman spectral study of human induced pluripotent stem cells (hiPSCs), and compare their Raman features to those of human embryonic stem cells (hESCs) and differentiated progeny of hESCs. Raman spectra from 687 cm(-1) to 1073 cm(-1) were collected from living hiPSCs, hESCs and hESCs non-specifically differentiated for 20 days. Spectra of hiPSCs and hESCs were found to be highly similar, and both were distinguishable from differentiated hESCs in terms of relative Raman peak intensities and variances. Principal component analysis (PCA) of the spectra demonstrated a clear discrimination between hiPSCs and differentiated hESCs. These results suggested that reprogramming returned human somatic cells to a state where the overall cellular composition was similar to that of human embryonic stem cells. Some metabolic differences between the two groups of pluripotent cells could be inferred, however it was unclear whether or not these differences were related to reprogramming.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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