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Enregistrement W1995551442 · doi:10.1046/j.1537-2995.2000.40101246.x

An amino acid substitution in the putative second extracellular loop of RBC band 3 accounts for the Froese blood group polymorphism

2000· article· en· W1995551442 sur OpenAlexaff
Kirk J. McManus, Krystine Lupe, Gail Coghlan, Teresa Zelinski

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonMolecular biologyBiologyGeneticsBand 3Point mutationSingle-strand conformation polymorphismGeneMutationMembrane protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The low incidence RBC antigen Fr(a) has been excluded from 17 of the 25 established blood group systems. Previous genetic analysis assigned the gene controlling Fr(a) expression to the same chromosomal region as the solute carrier family 4, anion exchanger member 1 gene (SLC4A1). Because SLC4A1 encodes RBC band 3 and controls the expression of Diego blood group system antigens, the possible relationship of Fr(a) to the Diego blood group system was investigated by molecular analysis of SLC4A1. STUDY DESIGN AND METHODS: Blood samples were obtained from the members of two unrelated Mennonite kindreds segregating for Fr(a). DNA was extracted, amplified by PCR using intronic primer sets flanking exons 11-20 of SLC4A1, and screened by single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis. Those exons displaying SSCPs were subjected to DNA sequence analysis. RESULTS: An exon 13 SSCP mobility shift was observed in the DNA from all Fr(a+) persons that was not seen in the DNA from Fr(a-) family members or control subjects. Linkage between the exon 13 SSCP and FR:(a) was established, with peak lods = 3.62 at theta = 0.00 for combined paternal and maternal meioses. DNA sequencing revealed a GAG --> AAG mutation that underlies a Glu480Lys substitution in RBC band 3. CONCLUSIONS: A point mutation in exon 13 of SLC4A1 accounting for a Glu480Lys substitution in band 3 controls Fr(a) expression. On the basis of these our results, the International Society of Blood Transfusion Working Party on Terminology for Red Cell Surface Antigens has assigned Fr(a) to the Diego blood group system, with the designation DI20.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,231
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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