MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1996073383 · doi:10.3109/19401736.2010.536538

The FISH-BOL collaborators' protocol

2011· article· en· W1996073383 sur OpenAlexfundno aff
Dirk Steinke, Robert Hanner

Notice bibliographique

RevueMitochondrial DNA · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome CanadaAlfred P. Sloan Foundation
Mots-clésBarcodeBiologyDNA barcodingFish <Actinopterygii>Identification (biology)Protocol (science)Cytochrome c oxidase subunit IComputational biologyMitochondrial DNAFisheryEvolutionary biologyGeneGeneticsComputer scienceEcologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Fish barcode of life (FISH-BOL) initiative seeks to establish a reference sequence library of short, standardized mitochondrial gene sequences derived from the 5' end of the cytochrome c oxidase subunit I gene (DNA barcodes) to facilitate the rapid, accurate, and cost-effective DNA-based identification of all fishes, regardless of life-stage, sex, or specimen condition. This task requires the participation of scientists from around the world and its success is predicated on the development and acceptance of standard protocols for the collection of specimens associated provenance data. Here, we provide guidelines for specimen collection, imaging, preservation, and archival, as well as meta-data collection and submission protocols developed for the FISH-BOL campaign in order to promote efficient participation in FISH-BOL by a broadening array of international participants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,178
Score d'incertitude au seuil0,596

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1780,102

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMitochondrial DNAMême sujetIdentification and Quantification in FoodTravaux en français237 207