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Enregistrement W1996238004 · doi:10.1186/2041-9414-1-7

UHRF1 is a genome caretaker that facilitates the DNA damage response to γ-irradiation

2010· article· en· W1996238004 sur OpenAlexafffund
Helena Mistry, Laura Tamblyn, Hussein Butt, Daniel Sisgoreo, Aileen Gracias, Meghan Larin, Kalpana Gopalakrishnan, M. Prakash Hande, John Peter McPherson

Notice bibliographique

RevueGenome Integrity · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDefence Science and Technology GroupNational Medical Research CouncilMedical Research CouncilCancer Research Society
Mots-clésChromatinDNA damageBiologyHistoneDNA repairCell biologyEpigeneticsDNADNA replicationMolecular biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: DNA double-strand breaks (DSBs) caused by ionizing radiation or by the stalling of DNA replication forks are among the most deleterious forms of DNA damage. The ability of cells to recognize and repair DSBs requires post-translational modifications to histones and other proteins that facilitate access to lesions in compacted chromatin, however our understanding of these processes remains incomplete. UHRF1 is an E3 ubiquitin ligase that has previously been linked to events that regulate chromatin remodeling and epigenetic maintenance. Previous studies have demonstrated that loss of UHRF1 increases the sensitivity of cells to DNA damage however the role of UHRF1 in this response is unclear. RESULTS: We demonstrate that UHRF1 plays a critical role for facilitating the response to DSB damage caused by gamma-irradiation. UHRF1-depleted cells exhibit increased sensitivity to gamma-irradiation, suggesting a compromised cellular response to DSBs. UHRF1-depleted cells show impaired cell cycle arrest and an impaired accumulation of histone H2AX phosphorylation (gammaH2AX) in response to gamma-irradiation compared to control cells. We also demonstrate that UHRF1 is required for genome integrity, in that UHRF1-depleted cells displayed an increased frequency of chromosomal aberrations compared to control cells. CONCLUSIONS: Our findings indicate a critical role for UHRF1 in maintenance of chromosome integrity and an optimal response to DSB damage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,441
Score d'incertitude au seuil0,696

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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