Sarcolipin retention in the endoplasmic reticulum depends on its C-terminal RSYQY sequence and its interaction with sarco(endo)plasmic Ca <sup>2</sup> +-ATPases
Notice bibliographique
Résumé
Sarcolipin (SLN) and phospholamban (PLN) are effective inhibitors of the sarco(endo)plasmic reticulum Ca(2+)-ATPase (SERCA). These homologous proteins differ at their N and C termini: the C-terminal Met-Leu-Leu in PLN is replaced by Arg-Ser-Tyr-Gln-Tyr in SLN. The role of the C-terminal sequence of SLN tagged N-terminally with the FLAG epitope (NF-SLN) in endoplasmic reticulum (ER) retention was investigated by transfecting human embryonic kidney-293 cells with cDNAs encoding NF-SLN or a series of NF-SLN mutants in which C-terminal amino acids were deleted progressively. Immunofluorescence and immunoblotting of transfected cells by using anti-FLAG antibodies indicated that NF-SLN and PLN tagged at its N terminus with the FLAG epitope, even when overexpressed, were restricted to the ER. However, C-terminal truncation deletions of SLN, which lacked RSYQY, were not localized to ER and did not inhibit Ca(2+)-dependent Ca2+ uptake by SERCA. The shortest deletion constructs, NF-SLN 1-22 and NF-SLN 1-23, did not express stable protein products. However, all NF-SLN cDNA constructs, including NF-SLN 1-22 and NF-SLN 1-23, were expressed stably and localized to the ER when they were coexpressed with SERCA2a. These results show that NF-SLN subcellular distribution depends on SERCA coexpression and on its luminal, C-terminal RSYQY sequence. By using immunoprecipitation and MS, glucose-regulated protein 78/BiP and glucose-regulated protein 94 were identified as proteins that interact with NF-SLN through the RSYQY sequence. Thus, in the absence of SERCA, retention of NF-SLN in the ER is mediated through its association with other components through the C-terminal RSYQY sequence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».