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Enregistrement W1996863846 · doi:10.1155/2013/754319

High-Yield Soluble Expression and Simple Purification of the Antimicrobial Peptide OG2 Using the Intein System in<i>Escherichia coli</i>

2013· article· en· W1996863846 sur OpenAlexaff
Feifei Han, Chao Luan, Haiwen Zhang, Jie Feng, Young‐Jun Choi, Denis Groleau

Notice bibliographique

RevueBioMed Research International · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesNational High-tech Research and Development ProgramFoundation for the Author of National Excellent Doctoral Dissertation of the People's Republic of China
Mots-clésInteinEscherichia coliAntimicrobialPichia pastorisPeptideFusion proteinExpression vectorCleavage (geology)BiochemistryBiologyAntimicrobial peptidesRecombinant DNAChemistryMicrobiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OG2 is a modified antimicrobial peptide, that is, derived from the frog peptide Palustrin-OG1. It has high antimicrobial activity and low cytotoxicity, and it is therefore promising as a therapeutic agent. Both prokaryotic (Escherichia coli) and eukaryotic (Pichia pastoris) production host systems were used to produce OG2 in our previous study; however, it was difficult to achieve high expression yields and efficient purification. In this study, we achieved high-yield OG2 expression using the intein fusion system. The optimized OG2 gene was cloned into the pTWIN1 vector to generate pTWIN-OG2-intein2 (C-terminal fusion vector) and pTWIN-intein1-OG2 (N-terminal fusion vector). Nearly 70% of the expressed OG2-intein2 was soluble after the IPTG concentration and induction temperature were decreased, whereas only 42% of the expressed of intein1-OG2 was soluble. Up to 75 mg of OG2-intein2 was obtained from a 1l culture, and 85% of the protein was cleaved by 100 mM DTT. Intein1-OG2 was less amenable to cleavage due to the inhibition of cleavage by the N-terminal amino acid of OG2. The purified OG2 exhibited strong antimicrobial activity against E. coli K88. The intein system is the best currently available system for the cost-effective production of OG2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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