MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1996889347 · doi:10.1086/590477

Population Structure and Genetic Diversity of<i>Clintonia udensis</i>Trautv. et Mey. (Liliaceae)

2008· article· en· W1996889347 sur OpenAlexaff
Yiling Wang, Genlou Sun, Sifeng Li, Zeng‐Qiang Qian, Guifang Zhao

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Plant Sciences · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhytochemical Studies and Bioactivities
Établissements canadiensSaint Mary's University
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Shaanxi ProvinceChinese Academy of Sciences
Mots-clésGenetic diversityAnalysis of molecular varianceBiologyGenetic distanceDiversity indexGenetic variationPopulationMantel testGeographical distanceEvolutionary biologyGene flowBotanyGeneticsEcologyGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetic diversity of 17 populations of Clintonia udensis Trautv. et Mey. was studied by using 15 intersimple sequence repeat primers. The results revealed a relatively high genetic diversity, with percentage of polymorphic $$\mathrm{bands}\,=98.8\% $$, Shannon’s information $$\mathrm{index}\,=0.56$$, and Nei’s gene diversity $$\mathrm{index}\,=0.38$$. The genetic diversity at the population level was considerably low, while a high level of genetic differentiation among populations was detected. This was confirmed by analysis of molecular variance (AMOVA). No significant statistical difference was found between geographic regions. Tetraploid populations showed an approximately equal level of genetic diversity compared with that of the diploid populations. No significant differentiation occurred between cytotypes. Shannon diversity index, Nei’s gene diversity index, and AMOVA analysis all showed that there was more genetic variation among diploid/tetraploid populations than within diploid/tetraploid populations. The Mantel test revealed no significant correlation between genetic distance and geographic distance at the species level. The biological characteristics of this species, the unique Clintonia‐type megasporogenesis and genetic drift, might account for the existence of relatively high interpopulation genetic variation. Cluster analysis gathered the 17 populations into two groups. Group I contained all diploids and made up geographic region I. This might be the center of origin of C. udensis. Group II had two coexisting cytotypes and made up geographic region IIa, IIb‐1, and IIb‐2, which might represent the secondary diversity centers of C. udensis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,304
Score d'incertitude au seuil0,159

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Plant SciencesMême sujetPhytochemical Studies and BioactivitiesTravaux en français237 207