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Enregistrement W1996941168 · doi:10.1242/jeb.033910

The involvement of SLC26 anion transporters in chloride uptake in zebrafish (<i>Danio rerio</i>) larvae

2009· article· en· W1996941168 sur OpenAlexaff
M. Bayaa, Branka Vulesevic, Andrew J. Esbaugh, Marvin H. Braun, Marc Ekker, Martin Grosell, Steve F. Perry

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensOntario GenomicsUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDanioZebrafishMorpholinoBiologyGene knockdownMessenger RNABiochemistryGeneMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY After demonstrating phylogenetic relatedness to orthologous mammalian genes, tools were developed to investigate the roles of three members (A3, A4 and A6c) of the SLC26 anion exchange gene family in Cl–uptake and HCO3 excretion in embryos and larvae of zebrafish(Danio rerio). Whole-mount in situ hybridization revealed the presence of SLC26 mRNA in gill primordia, mesonephros and heart(slc26a3 and a4 only) at 5–9 days postfertilization(d.p.f.). SLC26A3 protein was highly expressed in lateral line neuromasts and within the gill, was localized to a sub-population of epithelial cells, which often (but not always) coexpressed Na+/K+-ATPase. SLC26 mRNA levels increased with developmental age, peaking at 5–10 d.p.f.;the largest increases in rates of Cl– uptake(\batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(J_{\mathrm{in}}^{\mathrm{Cl}^{-}}\) \end{document}) preceded the mRNA spike, occurring at 2–5 d.p.f. Raising zebrafish in water with a low [Cl–] caused marked increases in \batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(J_{\mathrm{in}}^{\mathrm{Cl}^{-}}\) \end{document} at 3–10 d.p.f. and was associated with increased levels of SLC26 mRNA. Raising fish in water of high [Cl–] was without effect on \batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(J_{\mathrm{in}}^{\mathrm{Cl}^{-}}\) \end{document} or SLC26 transcript abundance. Selective gene knockdown using morpholino antisense oligonucleotides demonstrated a significant role for SLC26A3 in Cl– uptake in larval fish raised in control water and roles for A3, A4 and A6c in fish raised in water with low [Cl–]. Prolonged (7 days) or acute (24 h) exposure of fish to elevated (2 or 5 mmol l–1) ambient [HCO3–] caused marked increases in Cl– uptake when determined in water of normal [HCO3–] that were accompanied by elevated levels of SLC26 mRNA. The increases in \batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(J_{\mathrm{in}}^{\mathrm{Cl}^{-}}\) \end{document} associated with high ambient [HCO3–] were not observed in the SLC26 morphants (significant only at 5 mmol l–1HCO3– for A4 and 2 mmol l–1HCO3– for A6c). Net base excretion was markedly inhibited in the slc26a3 and a6c morphants thereby implicating these genes in Cl–/HCO3– exchange. The results suggest that under normal conditions, Cl– uptake in zebrafish larvae is mediated by SLC26A3 Cl–/HCO3– exchangers but under conditions necessitating higher rates of high affinity Cl–uptake, SlC26A4 and SLC26A6c may assume a greater role.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,079
Score d'incertitude au seuil0,225

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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