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Enregistrement W1997135816 · doi:10.1111/his.12214

An interobserver reproducibility study on invasiveness of bladder cancer using virtual microscopy and heatmaps

2013· article· en· W1997135816 sur OpenAlexaff
Éva Compérat, Lars Egevad, Antonio López-Beltrán, Philippe Camparo, Ferrán Algaba, Mahul B. Amin, Jonathan I. Epstein, Hans Hamberg, Christina Hulsbergen‐van de Kaa, Glen Kristiansen, Rodolfo Montironi, Chin‐Chen Pan, Fabrice Heloir, Kilian M. Treurniet, Jenna Sykes, Theodorus van der Kwast

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKappaMedicineBladder cancerCohen's kappaReproducibilityTelepathologyMedical physicsVirtual microscopyStandardizationGenitourinary systemRadiologyPathologyCancerInternal medicineStatisticsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: The distinction between non-invasive (pTa) and invasive (pT1) non-muscle invasive bladder cancer (NMIBC) is subject to considerable interobserver variation. We aimed to generate a teaching set of images based on the diagnostic opinions of a panel of expert genitourinary pathologists. METHODS AND RESULTS: Twenty-five transurethral resection specimens initially reported as pT1 NMIBC from two university hospitals were selected on the basis of potential uncertainty of stromal invasion. Digitized slides were reviewed independently by a panel of eight genitourinary pathologists, who annotated any invasive area if present. Annotations were reviewed by the lead panel, and heatmaps of annotated areas were constructed. Reasons for discrepancies were analysed, and kappa scores were calculated to determine agreement among the eight panellists. Full agreement by the eight panellists was obtained in 11 of 25 cases (44%), with a multi-rater (Fleiss) kappa of 0.47 (P < 0.0001). After joint review of the seven discordant (agreement <75% of panellists) cases, consensus was obtained for six cases, and a teaching set of images was generated. CONCLUSIONS: Interobserver agreement among the panellists in the selected cases was moderate, but consensus could be reached in almost all cases. Heatmaps proved to be instrumental in generating a teaching set of images for standardization of histological criteria for NMIBC invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,057
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,099
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,943
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0570,099
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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