Substantial Intrapatient Differences in the Breadth and Specificity of HIV-Specific CD8+ T-Cell Interferon-γ and Proliferation Responses
Notice bibliographique
Résumé
HIV vaccine design and evaluation require a better understanding of protective immune responses. HIV-specific CD8+ T-cell responses have been characterized extensively using interferon-gamma (IFN-gamma) enzyme-linked immunosorbent spot (ELISPOT) assays, which do not always correlate with control of viral replication or disease progression. Alternative aspects of CD8+ T-cell responses, in particular those associated with a central memory (Tcm) phenotype, may be more protective against disease progression. To determine the extent that the breadth and specificity of HIV-specific CD8+ T-cell responses differ based on immunological readout, we screened in HIV-infected Kenyan sex workers for responses to HIV Env using IFN-gamma ELISPOT and 6-day carboxyfluorescein succinimidyl ester-based proliferation assays. This comparison revealed substantial differences in the epitopes recognized when the assay readout was IFN-gamma versus proliferation. Although 24 and 41 IFN-gamma and proliferative responses were identified, overlapping specificity was observed for only 5 responses. Breadth also differed between assays in several patients. Env-specific IFN-gamma breadth was found to correlate inversely with CD4 count (r = -0.66, P = 0.005), although this was not the case for proliferation. These data suggest that efforts to define HIV-specific CD8+ T-cell responses may need to be revisited using additional immunological readouts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».