A Molecular Phylogeny for Yponomeutoidea (Insecta, Lepidoptera, Ditrysia) and Its Implications for Classification, Biogeography and the Evolution of Host Plant Use
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Yponomeutoidea, one of the early-diverging lineages of ditrysian Lepidoptera, comprise about 1,800 species worldwide, including notable pests and insect-plant interaction models. Yponomeutoids were one of the earliest lepidopteran clades to evolve external feeding and to extensively colonize herbaceous angiosperms. Despite the group's economic importance, and its value for tracing early lepidopteran evolution, the biodiversity and phylogeny of Yponomeutoidea have been relatively little studied. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Eight nuclear genes (8 kb) were initially sequenced for 86 putative yponomeutoid species, spanning all previously recognized suprageneric groups, and 53 outgroups representing 22 families and 12 superfamilies. Eleven to 19 additional genes, yielding a total of 14.8 to 18.9 kb, were then sampled for a subset of taxa, including 28 yponomeutoids and 43 outgroups. Maximum likelihood analyses were conducted on data sets differing in numbers of genes, matrix completeness, inclusion/weighting of synonymous substitutions, and inclusion/exclusion of "rogue" taxa. Monophyly for Yponomeutoidea was supported very strongly when the 18 "rogue" taxa were excluded, and moderately otherwise. Results from different analyses are highly congruent and relationships within Yponomeutoidea are well supported overall. There is strong support overall for monophyly of families previously recognized on morphological grounds, including Yponomeutidae, Ypsolophidae, Plutellidae, Glyphipterigidae, Argyresthiidae, Attevidae, Praydidae, Heliodinidae, and Bedelliidae. We also assign family rank to Scythropiinae (Scythropiidae stat. rev.), which in our trees are strongly grouped with Bedelliidae, in contrast to all previous proposals. We present a working hypothesis of among-family relationships, and an informal higher classification. Host plant family associations of yponomeutoid subfamilies and families are non-random, but show no trends suggesting parallel phylogenesis. Our analyses suggest that previous characterizations of yponomeutoids as predominantly Holarctic were based on insufficient sampling. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: We provide the first robust molecular phylogeny for Yponomeutoidea, together with a revised classification and new insights into their life history evolution and biogeography.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».